在使用Windows 10系统的IE浏览器时，如果遇到提示是否停止运行此脚本的问题，这通常意味着网页中的某些JavaScript代码可能被误判为潜在的恶意活动。

遇到这种情况，您可以采取以下几种处理方案：

首先，检查浏览器的安全设置。确保您的IE浏览器安全级别设置得当。如果设置过高，可能会导致正常的脚本被阻止执行。您可以在“工具”菜单中找到“Internet选项”，然后进入“安全”标签页进行调整。

其次，考虑使用其他浏览器。现代浏览器如Chrome、Firefox等对JavaScript的支持更为完善，并且安全性也更高。

此外，您可以尝试清除浏览器缓存和Cookies。这有助于清除可能引起问题的临时文件和数据。

如果问题依然存在，可以考虑安装防病毒软件进行全面扫描，以确保您的系统没有受到恶意软件的影响。

最后，如果确定是某个特定网站的问题，您可以将该网站添加到IE的信任站点列表中。这样可以减少不必要的安全警告。

通过以上方法，您应该能够解决IE提示是否停止运行此脚本的问题，并恢复正常浏览体验。