南京地铁3号线和1号线均经过南京南站。这两条线路在南京南站设有换乘站，方便乘客根据目的地选择不同的线路出行。南京地铁3号线是一条贯穿南京东西方向的主干线路，而1号线则连接了南京的南北方向。乘客在南京南站可以通过便捷的换乘设施轻松实现两条线路之间的转换，极大地方便了来往于南京南站的乘客。